Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms