Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms