Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13Q9UHV7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED13Q9UHV7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED13Q9UHV7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED13Q9UHV7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED13Q9UHV7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED13Q9UHV7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED13Q9UHV7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED13Q9UHV7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms