Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCF2Q9UG63 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCF2Q9UG63 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms