Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CLN8Q9UBY8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CLN8Q9UBY8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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CLN8Q9UBY8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLN8Q9UBY8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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