Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms