Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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