Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms