Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNK4Q9NYG8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNK4Q9NYG8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms