Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCM2LQ9NUG4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms