Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms