Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms