Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms