Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms