Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms