Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms