Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms