Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms