Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms