Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms