Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOPXQ9BPY8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms