Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP8Q99708 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms