Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms