Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE2Q96FN4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE2Q96FN4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms