Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms