Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms