Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms