Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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