Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLD3Q8IV08 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms