Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms