Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms