Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH2Q76I76 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms