Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms