Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms