Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD1Q6UWL2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms