Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms