Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms