Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms