Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms