Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms