Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms