Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEXMIFQ5QGS0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms