Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC27A3Q5K4L6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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