Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms