Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms