Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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