Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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