Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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