Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL15Q16663 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL15Q16663 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL15Q16663 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL15Q16663 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL15Q16663 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL15Q16663 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL15Q16663 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms