Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms